این برنامه لینوکس به نام ADOMA است که آخرین نسخه آن را می توان با نام adoma-1.0.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام ADOMA را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
ADOMA
شرح
ADOMA مخفف: Alternative Display Of Multiple Alignment است. ADOMA می تواند چهار نمایشگر مختلف از یک تراز چند دنباله ایجاد کند: یک تراز ClustalW در قالب HTML، یک تراز ClustalW ساده شده در قالب HTML و/یا txt و یک تراز ClustalW رنگی در قالب HTML. برای نمونه هایی از این فایل های خروجی، اسکرین شات ها را بررسی کنید. ADOMA از ClustalW برای ایجاد تراز چندگانه از DNA یا توالی های پروتئین استفاده می کند و آنها را کمی متفاوت از خروجی معمولی ClustalW نشان می دهد. ADOMA یک برنامه خط فرمان است که به راحتی در خطوط لوله استفاده می شود.
برای اطلاعات بیشتر README.md را در بخش Files بررسی کنید.
نحوه استناد به ADOMA:
Zaal, D. and Nota, B. (2016)، ADOMA: یک ابزار خط فرمان برای اصلاح خروجی تراز چندگانه ClustalW. مول. Inf., 35: 42-44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
یونیکس شل، پایتون
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/adoma/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
