این برنامه لینوکس با نام bspipe است که آخرین نسخه آن را می توان با نام bspipe-1.3.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن به نام bspipe را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
bspipe
Ad
شرح
BSpipe یک خط لوله جامع از کنترل کیفیت توالی و نقشه برداری تا تجزیه و تحلیل عملکردی مناطق متیله متفاوت است:
(1) ارزیابی کیفیت توالی،
(2) تمیز کردن توالی،
(3) نگاشت خواندن توالی،
(4) کمی سازی متیلاسیون،
(4) مقایسه نمونه بر اساس مشخصات متیلاسیون،
(5) شناسایی DMRs (مناطق متیله متفاوت)،
(6) حاشیه نویسی DMR ها،
(7) تجزیه و تحلیل عملکردی ژن های متیله متفاوت،
(8) تولید فایل های ورودی برای تجسم، و
(9) پشتیبانی از فناوری های توالی یابی پیشرفته مانند TAB-seq، OxBS-seq، MAP-it و NOMe-seq.
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
Unix Shell، Perl، S/R
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/bspipe/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
