این برنامه لینوکس با نام COPERead است که آخرین نسخه آن را می توان با نام cope-v1.2.5.tgz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام COPERead را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
COPERخواند
Ad
شرح
COPE (اتصال خواندههای جفت انتهایی همپوشانی) روشی برای تراز کردن و اتصال قرائتهای جفت انتهایی توالیشده illumina است که اندازه درج کوچکتر از مجموع دو طول خوانده شده است. قرائتهای متصل میتوانند در مونتاژ ژنوم و توالییابی مجدد استفاده شوند. و تحقیق رونوشت.
نقل قول کامل:
COPE: یک ابزار اتصال جفت پایان خواندن دقیق مبتنی بر k-mer برای تسهیل مونتاژ ژنوم
Binghang Liu; جیانیینگ یوان؛ Siu-Ming Yiu; ژنیو لی; Yinlong Xie; Yanxiang Chen; یوجیان شی; هائو ژانگ؛ ینگروی لی; تک واه لام; رویبانگ لو
بیوانفورماتیک (2012) 28 (22): 2870-2874; doi: 10.1093/bioinformatics/bts563
امکانات
- اتصال جفت پایان خوانده شده همپوشانی
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/coperead/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.