این برنامه لینوکس به نام CStone است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان cstone.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام CStone را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
CStone
شرح
CStone یک اسمبلر جدید برای داده‌های RNA-Seq است که از نمودارهایی مانند de Bruijn استفاده می‌کند و هر یک از اجزای تولید شده را با یکی از سه سطح طبقه‌بندی گراف حاشیه‌نویسی می‌کند که نشان می‌دهد می‌توان تضمین کرد که غیرکایمریک است یا خیر. سطوح طبقه بندی بستگی به پیچیدگی خانواده ژنی دارد که قرائت ها از آن مشتق شده اند. به عنوان یک محصول جانبی، این همچنین بینشی در مورد ساختار ساختاری خانواده‌های ژنی که توالی‌یابی شده‌اند، ارائه می‌کند. جزئیات بیشتر به زودی در مقاله ما در دسترس خواهد بود: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34813594/.
امکانات
- مونتاژ نوین داده های RNA-Seq.
- شناسایی کانتیگ های غیرکایمریک.
- سازگاری بین پلتفرم
- شیشه اجرایی موجود است.
- بدون نیاز به بسته های خارجی
- کد به راحتی قابل پیگیری و گنجانده شده با ابزارهای دیگر.
- اطلاعات در مورد پیچیدگی خانواده های ژنی زمینه ای.
- دو برویین رویکرد (مهم تر) را دوست دارد.
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/cstone/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
