این برنامه لینوکس با نام FishingCNV برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می توان با نام FishingCNV_1.5.3.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام FishingCNV را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت رایگان در لینوکس با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
FishingCNV برای اجرای آنلاین در لینوکس
شرح
FishingCNV، یک ابزار نرم افزاری توسعه یافته در دانشگاه مک گیل، ابزاری برای تجزیه و تحلیل جامع تغییرات تعداد کپی نادر در داده های توالی اگزوم با کارایی بالا است. ورودی ها فایل های پوشش استانداردی هستند که توسط Genome Analysis ToolKit (GATK) تولید می شوند و خروجی فایلی حاوی CNV های احتمالی است.این برنامه در 2 نسخه مختلف عرضه می شود
* نسخه رابط کاربری گرافیکی (FishingCNV_X.XXzip)
* نسخه خط فرمان (FishingCNV_X.X_pipeline)
برای یافتن نسخه‌های مختلف، فایل‌های ما را مرور کنید.
امکانات
- رابط کاربر گرافیکی
- تجزیه و تحلیل CNV برای آزمایش/کنترل همسان (مانند سرطان/تومور)
- تجزیه و تحلیل CNV برای نمونه های غیر همسان
- حذف اثر دسته ای در مجموعه کنترل
- خروجی جدا شده با تب را می توان در اکسل مشاهده کرد
- فایل خروجی اضافی را می توان در IGV تجسم کرد
- نمودارهای توزیع و نمودارهای پرت برای هر کروموزوم
مخاطبان
علم/تحقیق، آموزش
رابط کاربری
جاوا Swing
زبان برنامه نویسی
جاوا، S/R
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/fishingcnv/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
