این برنامه لینوکس به نام locusvu برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام LocusVu.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام locusvu را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
locusvu برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
شرح
LocusVu یک ابزار نرم افزاری جدید مبتنی بر جاوا است که لیستی از مکان های ژنومی (موقعیت های روی کروموزوم) را به عنوان ورودی می پذیرد و واکشی اطلاعات مرتبط (باند سیتوژنتیک، نام ژن، داده های OMIM و غیره) را از پایگاه های داده عمومی مانند مرورگر ژنوم UCSC به صورت خودکار انجام می دهد. پایگاه داده سپس چندین گردش کار را روی نتایج بازیابی شده فعال می کند، مانند مقایسه مجموعه داده های متعدد (ژنومیک مقایسه ای)، مشاهده ژن های همسایه برای یک مکان از درون خود ابزار، یا نمایش گرافیکی این نتایج در نمودارهای میله ای / دایره ای. LocusVu دارای یک رابط کاربری گرافیکی ساده با کاربری آسان در قسمت جلویی است که تعامل بصری کاربر را با منطق اصلی امکان پذیر می کند.این ابزار را می توان به راحتی برای افزودن پشتیبانی از سایر پایگاه های داده (مانند Ensembl) یا واکشی اطلاعات گسترش داد
از جداول دیگر در پایگاه داده بنابراین، LocusVu یک چارچوب اساسی ارائه می‌کند که می‌تواند توسط کاربران و توسعه‌دهندگان به طور یکسان در ساده‌سازی گردش‌های کاری موجود و ایجاد موارد جدیدتر برای پشتیبانی از تجزیه و تحلیل داده‌ها در ژنومیک استفاده شود.
امکانات
- بازیابی داده ها را از پایگاه های داده (در حال حاضر پایگاه داده مرورگر ژنوم UCSC) به صورت خودکار انجام می دهد.
- گردش کار را در نتایج بازیابی شده فعال می کند مانند..
- ..مقایسه مجموعه داده های متعدد (ژنومیک مقایسه ای)
- .. مشاهده ژن های همسایه برای یک مکان (از درون خود ابزار)
- .. نمایش گرافیکی نتایج (نمودار میله ای / دایره ای)
- رابط کاربری گرافیکی آسان برای استفاده در جلو برای استفاده بصری
- ورود با Log4j برای رفع اشکال آسان
- به راحتی قابل گسترش است
مخاطبان
علم/تحقیق، توسعه دهندگان
رابط کاربری
جاوا Swing
زبان برنامه نویسی
جاوه
محیط پایگاه داده
خروجی
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/locusvu/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
