این برنامه لینوکس به نام P3BSseq برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می توان با نام P3BSseq_v2.1.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام P3BSseq را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت رایگان در لینوکس با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
P3BSseq برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
شرح
پردازش توالی یابی بی سولفیت (BSseq) یکی از پیچیده ترین کاربردهای توالی یابی نسل بعدی (NGS) است. اگرچه برخی از ابزارهای پردازش BSseq در دسترس هستند، اما آنها پراکنده هستند، به پارامترهای گیج کننده نیاز دارند و زمان اجرا و مصرف حافظه را می طلبند. ما P3BSseq را توسعه داده‌ایم، یک خط لوله پردازش موازی برای تجزیه و تحلیل سریع، دقیق و خودکار BSseq که می‌خواند که برش، تراز، حاشیه‌نویسی، ثبت نتایج میانی، انجام ارزیابی کیفیت تبدیل بی سولفیت، تولید متیلوم BED و فایل‌های گزارش براساس استانداردهای NIH. P3BSseq از نقشه‌بردارهای شناخته‌شده BSseq از نظر زمان اجرا و نیازهای سخت‌افزار رایانه بهتر عمل می‌کند. ما پارامترهای P3BSseq را هم برای کتابخانه‌های جهت‌دار و هم برای کتابخانه‌های غیرجهتی، و هم برای خواندن یک‌پایه و جفتی کل ژنوم و BSseq با نمایش کاهش‌یافته بهینه‌سازی کردیم. P3BSseq یک راه حل کارآمد کاربر پسند برای تجزیه و تحلیل بالادستی BSseq است که فقط به دانش اولیه رایانه و NGS نیاز دارد.امکانات
- پردازش داده های توالی نسل بعدی (NGS).
- تجزیه و تحلیل متیلومیک DNA
- پردازش موازی
- کاهش نمایش توالی بی سولفیت (RRBS)
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
کنسول / ترمینال
زبان برنامه نویسی
پــایتــون
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
