این برنامه لینوکس به نام Pathoscope است که آخرین نسخه آن را می توان با نام pathoscope_2.0.6_clinical_pathoscope_1.0.3.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام Pathoscope را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
پاتوسکوپ
Ad
شرح
این صفحه برای اهداف آرشیوی اینجاست. لطفا برای دریافت آخرین نسخه نرم افزار به github مراجعه کنید: https://github.com/pathoscopePathoScope توالی‌یابی نسل بعدی را از نمونه مخلوط می‌خواند و پیش‌بینی می‌کند که کدام ژنوم وجود دارد. ما از یک چارچوب بیزی ترکیب شده با یک تراز مبتنی بر مرجع اولیه برای اختصاص خواندن به ژنوم منشاء صحیح استفاده می کنیم.
پاتوسکوپ 2.0:
ویکی:
http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/Home/
آموزش:
http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoscope2.0_v0.02_tutorial.pdf
نسخه پاتوسکوپ بالینی: http://sourceforge.net/p/pathoscope/wiki/clinical_pathoscope/
دانلود PathoQC: http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
انتشارات: http://www.microbiomejournal.com/content/2/1/33
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/262
http://genome.cshlp.org/content/23/10/1721
پشتیبانی:
PS: لطفاً اگر سؤالی دارید به mani2012 در bu dot edu ایمیل بفرستید.
امکانات
- PathoQC: PathoQC یک برنامه مستقل کنترل کیفیت و پیش پردازش برای یک مجموعه داده با توان عملیاتی بالا است. لطفا PathoQC را دانلود کنید http://sourceforge.net/projects/pathoscope/files/pathoqc_v0.1.4.tar.gz/download
- انتشارات PathoQC: http://la-press.com/article.php?article_id=4828
- پشتیبانی: https://groups.google.com/d/forum/pathoscope
- صفحه آزمایشگاه: http://jlab.bu.edu/software/
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/pathoscope/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
