این برنامه لینوکس به نام SeqSelector است که آخرین نسخه آن را می توان با نام SeqSelector1.1b.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام SeqSelector را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
SeqSelector
Ad
شرح
مجموعه ابزار SeqSelector مجموعه‌ای از اسکریپت‌های پایتون مستقل و کاربرپسند است تا انتخاب توالی‌ها را برای غنی‌سازی هدفمند کتابخانه‌های نسل بعدی از طریق ضبط توالی مبتنی بر هیبریداسیون تسهیل کند. اسکریپت ها نیازی به دانش برنامه نویسی ندارند، و می توانند برای توالی ژنوم گونه های مدل یا غیرمدل اعمال شوند. ما یک جریان کاری را پیشنهاد می‌کنیم که در آن ژن‌های مورد علاقه ابتدا از مطالعات قبلی و مجموعه داده‌های در دسترس عموم از حاشیه‌نویسی ژن عملکردی شناسایی می‌شوند. هنگامی که فهرستی از ژن های کاندید شناسایی شد، توالی آنها از ژنوم مرجع انتخاب می شود. این توالی ها به عنوان پرس و جو در طول جستجوی BLAST از ژنوم بدون حاشیه یک گونه غیر مدل استفاده می شوند و سپس توالی های مربوطه برگردانده می شوند که می توانند برای طراحی طعمه هایی برای گرفتن توالی مبتنی بر هیبریداسیون استفاده شوند.
زبان برنامه نویسی
پــایتــون
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/seqselector/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
