انگلیسیفرانسویاسپانیایی

Ad


فاویکون OnWorks

ViralFusionSeq [VFS] برای اجرا در لینوکس دانلود آنلاین برای L

دانلود رایگان ViralFusionSeq [VFS] برای اجرا در لینوکس برنامه آنلاین لینوکس برای اجرای آنلاین در اوبونتو آنلاین، فدورا آنلاین یا دبیان آنلاین

این برنامه لینوکس با نام ViralFusionSeq [VFS] برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می‌توانید با نام vfs-2016-08-17.r2.tar.gz دانلود کنید. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.

این برنامه با نام ViralFusionSeq [VFS] را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت رایگان در لینوکس با OnWorks اجرا شود.

برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:

- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.

- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.

- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.

- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.

- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.

- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.

عکس ها

Ad


ViralFusionSeq [VFS] برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین


شرح

VFS به طور کامل تحت سیستم اوبونتو/دبیان آزمایش شد.

** اطلاعیه 1**: VFS برتر از Virus-Clip است. https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/files/VFS.vs.Virus-Clip.pdf/download

از سال 2016، VFS تنها ابزار یکپارچه سازی ویروسی است که در سیستم NIH HPC موجود است.
https://hpc.nih.gov/apps/ViralFusionSeq/

ViralFusionSeq (VFS) یک ابزار همه کاره توالی یابی با توان عملیاتی بالا (HTS) برای کشف رویدادهای یکپارچه سازی ویروسی و بازسازی رونوشت های همجوشی در وضوح تک پایه است.

VFS اطلاعات برش نرم، تجزیه و تحلیل جفت خواندن، و مونتاژ de novo هدفمند را برای کشف و حاشیه نویسی رویدادهای همجوشی ویروسی و انسانی ترکیب می کند.

یک مدل آماری تجربی ساده اما مؤثر برای ارزیابی کیفیت نقاط شکست همجوشی استفاده می‌شود.

حداقل پارامترهای تعریف شده توسط کاربر مورد نیاز است.

کد منبع به همراه راهنمای کاربر و راهنمای نصب VFS در بخش "Files" sourceforge موجود است.

ارجاع: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

امکانات

  • قابل اجرا و به طور کامل با استفاده از داده های RNA-Seq و DNA-Seq آزمایش شده است
  • از اطلاعات توالی بریده شده (CS) و جفت پایان (RP) برای کشف یکپارچگی ویروسی استفاده کنید.
  • بازسازی توالی رونوشت فیوژن با استفاده از اطلاعات CS و RP


مخاطبان

علم/تحقیق



زبان برنامه نویسی

پرل



این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/viralfusionseq/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.


سرورها و ایستگاه های کاری رایگان

دانلود برنامه های ویندوز و لینوکس

دستورات لینوکس

Ad