این برنامه ویندوز با نام EigenMS است که آخرین نسخه آن را می توان با نام EigenMS.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام EigenMS را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
EigenMS
Ad
شرح
EigenMS یک روش عادی سازی است که در R (و نسخه قدیمی تر در Matlab) پیاده سازی شده است که به عنوان مجموعه ای از دو تابع موجود است که باید در یک دنباله استفاده شوند.
لطفا فایل EigenMS.zip (آخرین نسخه) را دانلود کنید.
آخرین نسخه آپلود شده در اکتبر 2017 دارای یک باگ برای عادی سازی گروه درمانی تکی است.
تغییر مقیاس از سال 2015 حذف شده است.
EigenMS از SVD برای شناسایی روندهای سوگیری در داده ها و حذف آنها استفاده می کند. EigenMS اثرات عوامل شناخته شده و ناشناخته را حذف می کند و می تواند برای هر پلتفرم -omic مورد استفاده قرار گیرد.
ما کاربرد آن را در LC-MS/MS و متابولومیک در دو مقاله زیر نشان داده ایم:
1) PMID: 19602524. "نرمال سازی شدت پیک در پروتئومیک های مبتنی بر MS از پایین به بالا با استفاده از تجزیه ارزش منفرد".
Karpievitch YV، Taverner T، Adkins JN، Callister SJ، Anderson GA، Smith RD، Dabney AR.
بیوانفورماتیک 2009
2) "نرمال سازی داده های متابولومیک با EigenMS"
Karpievitch YV، Nikolic SB، Wilson R، Sharman JE، Edwards LM.
PLoS One 2014
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
متلب، S/R
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/eigenms/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
