این برنامه ویندوز با نام Scaffold_Builder است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان scaffold_builder_v2.2.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام Scaffold_Builder را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
داربست_ساز
شرح
Scaffold_builder نرم‌افزاری است که برای سفارش‌بندی کانتیگ‌های تولید شده توسط توالی‌سازی پیش‌نویس در امتداد یک دنباله مرجع است. شکاف‌ها با N پر می‌شوند و همپوشانی‌های کوچک با الگوریتم Needleman–Wunsch و اجماع ایجاد شده با کدهای IUPAC تراز می‌شوند. Scaffold_builder می‌تواند با آشکار کردن موارد گمشده و اجازه دادن به توالی‌یابی هدفمند برای بستن آن شکاف‌ها، به مونتاژ و حاشیه‌نویسی ژنوم‌ها کمک کند.(ج) Silva GG، Dutilh BE، Matthews TD، Elkins K، Schmieder R، Dinsdale EA، Edwards RA.
لطفاً استناد کنید: "ترکیب مونتاژ de novo و مرجع هدایت شده با Scaffold_builder"، کد منبع برای زیست شناسی و پزشکی 2013.
امکانات
- داربست
- پیش نویس ژنوم
- بیوانفورماتیک
رابط کاربری
مبتنی بر وب، خط فرمان
زبان برنامه نویسی
پــایتــون
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/scaffold-b/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
