Il s'agit de la commande bowtie-inspect qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos nombreux postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bowtie-inspect - extrait les informations d'un index de nœuds papillon
SYNOPSIS
nœud papillon-inspecter [Options]*
DESCRIPTION
nom de fichier ebwt moins .1.ebwt/.2.ebwt de fin
Par défaut, imprime les enregistrements FASTA des séquences nucléotidiques indexées au format standard
dehors. Avec -n, imprime juste les noms. Avec -s, imprime juste un résumé de l'index
paramètres et séquences. Avec -e, préserve les couleurs le cas échéant.
OPTIONS
--grand-index
forcer l'inspection du « grand » index, même si un « petit » est présent.
-a/--de l'autre côté
Nombre de caractères dans la sortie FASTA (par défaut : 60)
-n/--noms
Imprimer uniquement les noms de séquence de référence
-s/--sommaire
Imprimer le résumé incl. noms de référence, longueurs, propriétés d'index
-e/--ebwt-ref
Reconstruire la référence à partir d'ebwt (lent, préserve les couleurs)
-v/--verbeux
Sortie détaillée (pour le débogage)
-h/--aider
imprimer une description détaillée de l'outil et de ses options
--Aidez-moi imprimer ce message d'utilisation
64 bits Construit sur lgw01-11 Thu Nov 26 11:13:31 UTC 2015 Compilateur : gcc version 5.2.1 20151123
(Ubuntu 5.2.1-25ubuntu1) Options : -O3 -Wl,--hash-style=les deux -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2
-fstack-protecteur-fort -Wformat -Werreur=format-sécurité -g -O2 -fstack-protecteur-fort
-Wformat -Werreur=format-sécurité -Wl,-Bfonctions-symboliques -Wl,-z,relro Sizeof {int, long,
long long, vide*, size_t, off_t} : {4, 8, 8, 8, 8, 8}
Utilisez bowtie-inspect en ligne à l'aide des services onworks.net
