Il s'agit de la commande bp_seqcutp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bp_seqcut.pl
UTILISATION
bp_seqcut.pl [options -h,-s,-e,-f,-w] ...
bp_seqcut.pl [options -h,-f,-w] se ...
-h ce message d'aide
-s sur quel résidu commencer à couper
-e sur quel résidu finir de couper
-f format des fichiers, par défaut FASTA mais vous pouvez spécifier tout ce qui est pris en charge par SeqIO à partir de BioPerl
-w largeur d'enveloppement dur, cela peut ne pas être pris en charge selon le format que vous utilisez
Description
Un script pour couper des séquences FASTA avec une plage donnée `fastacut -s 1 -e 10 *.fasta` ou
`fastacut 1-10 *.fasta`. Ceci est juste un emballage pratique autour du module Bio::SeqIO.
Utile si vous souhaitez découper une section d'un alignement pour créer un profil d'un
région de séquence.
Utilisez bp_seqcutp en ligne à l'aide des services onworks.net