cmtk-dwi_mask_bad_slices - En ligne dans le cloud

PROGRAMME:

Nom

dwi_mask_bad_slices - Recherche les mauvaises tranches dans un ensemble d'images pondérées en diffusion.

SYNOPSIS

dwi_mask_bad_slices DiffusionImageChemins

DESCRIPTION

Cet outil lit un ensemble d'images IRM 3D pondérées en diffusion et trouve les mauvaises tranches. Une mauvaise tranche
dans une image de diffusion est détectée comme une image dont l'intensité moyenne est en dehors d'une plage spécifiée.
intervalle autour de la moyenne des moyennes de toutes les tranches correspondantes du reste
images de diffusion.

OPTIONS

Global Boîte à outils Options (celles-ci commun by TOUTE CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.

--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.

- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.

--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.

--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.

--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.

--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.

--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).

--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).

Entrée Options
--b0compte
Nombre d'images b=0 au début de la liste d'images. Ceux-ci ne sont pas inclus dans
la détection ou le masquage des tranches incorrectes, mais sont également écrits dans le répertoire de sortie pour
commodité. On suppose que toutes les images b=0 se trouvent au début de la liste des
images d'entrée, mais pas à la fin ou au milieu. [Défaut: 0]

--orientation-tranche
Définir l'orientation des tranches des images de diffusion. Valeurs prises en charge : « axial »,
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", où la valeur par défaut est "axial",
ou utilisez l'un des éléments suivants :

--axial
Tranches axiales [Ce is le défaut]

--sagittal
Tranches sagittales

--coronaire
Tranches coronales

--tranche-x
L'axe de coordonnées X est la direction de la tranche

--tranche-y
L'axe de coordonnées Y est la direction de la tranche

--slice-z
L'axe de coordonnées Z est la direction de la tranche [Ce is le défaut]

Mal Tranche Détection
--stdev
Seuil pour l'identification de la mauvaise tranche en unités d'écarts types d'intensité sur
toutes les tranches correspondantes des images de diffusion restantes. [Défaut: 3]

Sortie Options
--convertir en
Type de données scalaire pour les images de sortie. Si votre valeur de remplissage est négative mais que votre
saisissez des données non signées, par exemple, assurez-vous de sélectionner un type de données signé pour le
sortir. Par défaut, le type de données de sortie est le même que le type d'entrée. Prise en charge
valeurs : "char", "byte", "short", "ushort", "int", "uint", "float", "double" ou use
l'un des suivants:

--carboniser
8 bits, signé

--octet
8 bits, non signé

--court
16 bits, signé

--ushort
16 bits, non signé

--int
32 bits signé

--uint
32 bits non signés

--flotter
32 bits virgule flottante

--double
64 bits virgule flottante

--valeur-padding , -p
Valeur de remplissage pour remplacer les données des tranches défectueuses détectées dans les images de sortie. [Défaut: -dix]

--répertoire de sortie , -o
Chemin du système de fichiers pour écrire des images avec des tranches défectueuses masquées (c'est-à-dire remplies d'un
valeur de remplissage). [Défaut: RIEN]

AUTEURS

Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko

Utilisez cmtk-dwi_mask_bad_slices en ligne à l'aide des services onworks.net