Il s'agit de la commande createChemistryHeader qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
createChemistryHeader.py - Créer un en-tête SAM avec la chimie de séquençage PacBio
d'information
DESCRIPTION
utilisation : getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES...]
fichier_alignement_entrée fichier_en-tête_sortie
createChemistryHeader crée un en-tête SAM qui contient les informations chimiques utilisées par
Trembler.
positionnel arguments:
fichier_alignement_entrée
Un fichier SAM ou BAM produit par BLSR.
fichier_en-tête_de sortie
Nom du fichier d'en-tête SAM ou BAM qui sera créé avec les informations de chimie
chargé.
facultatif arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
--déboguer
Sortir des informations de journal détaillées. (par défaut : Faux)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES...]
Les fichiers bas ou bax contenant les lectures qui ont été alignées dans le
input_alignment_file. Peut également être un fofn de fichiers bas ou bax. (par défaut : aucun)
Utilisez createChemistryHeader en ligne à l'aide des services onworks.net