Il s'agit de la commande DB2fasta qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
DB2fasta - crée des fichiers fasta à partir d'une base de données Dazzler
SYNOPSIS
DB2fasta [-vU] [-wint(80)] chemin:db
DESCRIPTION
L'ensemble des fichiers .fasta pour la base de données donnée sont recréés à partir de la base de données exactement comme ils étaient
saisir. C'est-à-dire qu'il s'agit d'une inversion parfaite, y compris la reconstitution du bon
en-têtes .fasta. A cause de cette propriété, on peut, si on le souhaite, supprimer la source .fasta
fichiers une fois qu'ils sont dans la base de données car ils peuvent toujours être recréés à partir de celle-ci. Par défaut le
les séquences de sortie sont en minuscules et 80 caractères par ligne. Les -U l'option spécifie la partie supérieure
la casse doit être utilisée et les caractères par ligne, ou largeur de ligne, peuvent être définis sur n'importe quel
valeur positive avec le -w option.
Utiliser DB2fasta en ligne à l'aide des services onworks.net
