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edialigne - En ligne dans le Cloud

Exécutez edialigne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks sur Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

Il s'agit de la commande edialigne qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

PROGRAMME:

PRÉNOM


edialign - Alignement multiple local de séquences

SYNOPSIS


edialigner -séquences ensemble de séquences -nucmode liste -revcomp booléen [-superposition sélection]
[-lien liste] [-maxfragl entier] -fragmat booléen -fragsim entier
[-son score booléen] [-seuil flotter] -masque booléen -dostars booléen
-étoile entier -outfile fichier de sortie -suite suite

edialigner -Aide

DESCRIPTION


edialigner est un programme en ligne de commande d'EMBOSS (« the European Molecular Biology Open
suite logicielle"). Il fait partie du ou des groupes de commandes "Alignement : Multiple".

OPTIONS


Entrée
-séquences ensemble de séquences

Supplémentaire
-nucmode liste
Mode d'alignement de séquences d'acides nucléiques (simple, traduit ou mixte) Valeur par défaut : n

-revcomp booléen
Valeur par défaut : N

-superposition sélection
Par défaut, les poids de chevauchement sont utilisés lorsque Nseq =<35 mais vous pouvez le définir sur « oui » ou
'non' Valeur par défaut : par défaut (lorsque Nseq =< 35)

-lien liste
Méthode de clustering pour construire un arbre de séquence (UPGMA, liaison minimale ou maximale
liaison) Valeur par défaut : UPGMA

-maxfragl entier
Valeur par défaut : 40

-fragmat booléen
Valeur par défaut : N

-fragsim entier
Valeur par défaut : 4

-son score booléen
Valeur par défaut : N

-seuil flotter
Valeur par défaut : 0.0

Sortie
-masque booléen
Valeur par défaut : N

-dostars booléen
Valeur par défaut : N

-étoile entier
Valeur par défaut : 4

-outfile fichier de sortie

-suite suite

Utiliser edialigne en ligne avec les services onworks.net


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