Il s'agit de la commande fastaq-add_indels qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fastaq_add_indels - Supprime ou insère des bases à des positions données
DESCRIPTION
utilisation : fastaq_add_indels [options]
Supprime ou insère des bases à des positions données
positionnel arguments:
infile Nom du fichier d'entrée
fichier de sortie
Nom du fichier de sortie
optionnel arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
-d Nom:début:bases, --effacer Nom:début:bases
Supprimer les bases données de la séquence donnée. Format identique à la vue samtools :
nom : début-fin. Cette option peut être utilisée plusieurs fois (une fois pour chaque région à
effacer). Les coordonnées qui se chevauchent seront fusionnées avant d'être supprimées
--delete_range P,début,étape
Supprime les bases à partir de la position P dans chaque séquence du fichier d'entrée. Supprime
start + (n-1)*bases de pas de la séquence n.
-i Nom:début:bases, --insérer Nom:début:bases
Insérez une chaîne aléatoire de bases à la position donnée. Le format est
nom:position:numéro_à_ajouter. Les bases sont ajoutées après la position. Cette option peut être
utilisé plusieurs fois
--insert_range P,début,étape
Insère des bases aléatoires commençant après la position P dans chaque séquence du fichier d'entrée.
Insère start + (n-1)*bases de pas dans la séquence n.
Utilisez fastaq-add_indels en ligne en utilisant les services onworks.net
