Il s'agit de la commande gt-encseq-decode qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos nombreux postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gt-encseq-decode - Décoder/extraire les séquences encodées.
SYNOPSIS
gt encseq décoder (fichier_séquence|nom_index)
DESCRIPTION
-miroré [oui|non]
ajouter virtuellement le complément inverse de chaque séquence (par défaut : non)
-sans perte [oui|non]
autoriser la récupération de la séquence d'origine sans perte (par défaut : non)
est [un magnifique]
spécifier le sens de lecture (fwd, cpl, rev, rcl) (par défaut : fwd)
-caractères simples [oui|non]
n'utilisez pas de GtEncseqReader mais accédez à chaque caractère de séquence séparément (par défaut :
non)
-séq [Plus-value]
extraire la séquence identifiée par son numéro (par défaut : indéfini)
-seqrange [Commencer fin]
extraire plusieurs séquences consécutives (par défaut : indéfini)
-sortir [...]
spécifier le format de sortie (choisir entre fasta|concat) (par défaut : fasta)
-gamme [Commencer fin]
plage concaténée à extraire (implique -sortir concat) (par défaut : non défini)
-sepchar [un magnifique]
spécifier le caractère à imprimer comme SÉPARATEUR (par défaut : |)
-Aide
afficher l'aide pour les options de base et quitter
-aide+
afficher l'aide pour toutes les options et quitter
-version
afficher les informations de version et quitter
DE LA LIGNE BOGUES
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