Il s'agit de la commande gt-gff3validator qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gt-gff3validator - Valide strictement les fichiers GFF3 donnés.
SYNOPSIS
gt gff3validateur [option ...] [GFF3_fichier ...]
DESCRIPTION
-vérification de type [un magnifique]
utiliser une ontologie donnée dans un fichier OBO pour valider les relations parent-enfant. Sinon
est donné, le fichier sofa.obo du répertoire gtdata/obo_files est utilisé. Si
un argument est donné, il est utilisé comme nom de fichier OBO. Dans le cas où un tel fichier ne
n'existe pas .obo est ajouté à l'argument et charge le nom de fichier résultant à partir du
Le répertoire gtdata/obo_files est tenté. (par défaut : non défini)
-xrfcheck [un magnifique]
vérifier les attributs Dbxref et Ontology_term pour une syntaxe correcte selon un
fichier de définition d'abréviation. Si aucun argument n'est donné, le fichier GO.xrf_abbs du
Le répertoire gtdata/xrf_abbr est utilisé. Si un argument est donné, il est utilisé comme un
nom de fichier pour un fichier d'abréviation. Dans le cas où un tel fichier n'existe pas,
.xrf_abbr est ajouté à l'argument et charge le nom de fichier résultant à partir du
Le répertoire gtdata/xrf_abbr est tenté. (par défaut : non défini)
-Aide
afficher l'aide et quitter
-version
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DE LA LIGNE BOGUES
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