Il s'agit de la commande gt-seqfilter qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
gt-seqfilter - Filtre le(s) fichier(s) de séquence donné(s) et affiche les résultats sur stdout.
SYNOPSIS
gt seqfiltre [option ...] [fichier_séquence ...]
DESCRIPTION
-Longueur minimale [Plus-value]
définir la longueur minimale qu'une séquence doit avoir pour passer le filtre (par défaut : undefined)
-longueur maximale [Plus-value]
définir la longueur maximale qu'une séquence peut avoir pour passer le filtre (par défaut : undefined)
-numéromax [Plus-value]
définir le nombre maximum de séquences pouvant passer le filtre (par défaut : undefined)
-échantillon [Plus-value]
définir une probabilité pour chaque séquence de passer le filtre (par défaut : 1.000000)
-étape [Plus-value]
seulement chaque étape-ème séquence passe le filtre (par défaut : 1)
-nowcards [oui|non]
filtrer les séquences contenant des caractères génériques (par défaut : non)
-largeur [Plus-value]
définir la largeur de sortie pour l'impression de séquence FASTA (0 désactive le formatage) (par défaut : 0)
-o [nom de fichier]
rediriger la sortie vers le fichier spécifié (par défaut : non défini)
-gzip [oui|non]
écrire le fichier de sortie compressé gzip (par défaut : non)
-bzip2 [oui|non]
écrire le fichier de sortie compressé bzip2 (par défaut : non)
-Obliger [oui|non]
forcer l'écriture dans le fichier de sortie (par défaut : non)
-Aide
afficher l'aide et quitter
-version
afficher les informations de version et quitter
DE LA LIGNE BOGUES
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