gt-simreads - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

gt-simreads - Simulez des lectures de séquençage à partir de positions aléatoires dans la ou les séquences d'entrée.

SYNOPSIS

gt lectures SIM [option ...]

DESCRIPTION

-sur une [Plus-value]
nombre de lectures souhaité (par défaut : non défini)

-couverture [Plus-value]
couverture souhaitée des lectures (par défaut : non défini)

-len [Plus-value]
longueur de lecture fixe (par défaut : non défini)

-minlen [Plus-value]
longueur de lecture minimale (par défaut : non défini)

-maxlen [Plus-value]
longueur maximale de lecture (par défaut : non défini)

-distiller [un magnifique]
utiliser le fichier de distribution de longueur de lecture (dans le format de sortie de l'outil seqstat) (par défaut :
indéfini)

-o [nom de fichier]
rediriger la sortie vers le fichier spécifié (par défaut : non défini)

-gzip [oui|non]
écrire le fichier de sortie compressé gzip (par défaut : non)

-bzip2 [oui|non]
écrire le fichier de sortie compressé bzip2 (par défaut : non)

-Obliger [oui|non]
forcer l'écriture dans le fichier de sortie (par défaut : non)

-p [oui|non]
afficher une barre de progression (par défaut : non)

-v [oui|non]
être verbeux (par défaut : non)

-ds [un magnifique]
distribution de sortie des positions de départ dans le fichier spécifié (par défaut : non défini)

M [un magnifique]
distribution de sortie des longueurs de lecture dans le fichier spécifié (par défaut : non défini)

-ss [oui|non]
simuler les lectures vers l'avant uniquement (par défaut : non)

-Aide
afficher l'aide pour les options de base et quitter

-aide+
afficher l'aide pour toutes les options et quitter

-version
afficher les informations de version et quitter

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