Il s'agit de la commande kmc_tools-kmers_subtract qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
kmc_tools-kmers_subtract - calcule la soustraction de deux bases de données KMC
SYNOPSIS
kmc_tools kmers_subtract <output
[output_params]>
DESCRIPTION
La base de données de sortie contiendra uniquement les k-mers qui sont présents dans le premier ensemble d'entrée mais
absent dans le second. La valeur du compteur est égale à la valeur de la première entrée
défini.
OPTIONS
Pour chaque entrée, il existe des paramètres supplémentaires :
-ci
exclure les k-mers se produisant moins de fois
-cx
exclure les k-mers survenant plus de fois
Pour la sortie, il existe des paramètres supplémentaires :
-ci
exclure les k-mers se produisant moins de fois
-cx
exclure les k-mers survenant plus de fois
-cs
valeur maximale d'un compteur
EXEMPLE
kmc -k28 fichier1.fastq kmers1 tmp
kmc -k28 fichier2.fastq kmers2 tmp
kmc_tools kmers_subtract kmers1 kmers2 kmers1_kmers2_subtract -cs200
Utilisez kmc_tools-kmers_subtract en ligne en utilisant les services onworks.net
