Il s'agit de la commande mapMers qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
mapMers - rapporte les statistiques de mappage des kmers aux séquences
SYNOPSIS
carteMers {-Statistiques|-Régions|-détails} -m taille mer -mers mers -séq fasta
OPTIONS
-Statistiques rapporte la moyenne, le minimum et le maximum pour chaque séquence, ainsi qu'un log2
histogramme des comptages
-Régions
signale les régions avec une couverture kmer
-détails
rapporte le décompte avant et arrière dans la base de données pour chaque kmer dans la séquence
-m taille mer
-mers mers
le Meryl(1) base de données
-séq fasta
fichier de séquence d'entrée
Utilisez mapMers en ligne en utilisant les services onworks.net