Il s'agit de la commande maskAlignedReads qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
maskAlignedReads.py - Masque les lectures alignées dans le fichier des régions
DESCRIPTION
utilisation : maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Utilisez in.cmp.h5 pour masquer les régions correspondantes des fichiers dans in.rgn.h5, écrivez la sortie dans un nouveau
rgn.fofn.
positionnel arguments:
dansFichierCmp
Un fichier cmp.h5 d'entrée.
inRgnFofn
Un fofn de fichiers de table de région d'entrée.
outRgnFofn
Un fofn de fichiers de table de région de sortie.
optionnel arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter
-v, --version
afficher le numéro de version du programme et quitter
-l FICHIER JOURNAL, --fichier journal FICHIER JOURNAL
Spécifiez un fichier auquel vous connecter. La valeur par défaut est stderr. (par défaut : aucun)
-d, --déboguer
Augmente la verbosité de la journalisation (par défaut : False)
-i, --Info
Afficher les entrées de journal informatives (par défaut : False)
Utilisez maskAlignedReads en ligne à l'aide des services onworks.net
