Il s'agit de la commande mia-2dmyocard-icaseries qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
mia-2dmyocard-icaseries - Exécuter une analyse ICA sur une série d'images 2D
SYNOPSIS
mia-2dmyocard-icaseries -i [choix]
DESCRIPTION
mia-2dmyocard-icaseries Ce programme est utilisé pour exécuter une ICA sur une série de myocardes
images de perfusion données dans un ensemble de segmentation afin de créer des références synthétiques qui
peut être utilisé pour la correction de mouvement par enregistrement d'image. Si l'objectif est d'exécuter une pleine
compensation de mouvement alors il vaut mieux exécuter mia-2dmyoica-non rigide, puisque ce programme est
essentiellement le même sans les bits d'enregistrement.
OPTIONS
Fichier-IO
-i --in-file=(entrée, requise); chaîne de caractères
jeu de données de perfusion d'entrée
-r --references=(sortie); chaîne de caractères
Base de nom de fichier pour les images de référence. Le type d'image et le schéma de numérotation sont
extrait des images d'entrée.
-c --save-cropped=(sortie); chaîne de caractères
enregistrer l'ensemble recadré de l'ensemble d'origine dans ce fichier, les fichiers image utiliseront
la racine du nom comme base de nom de fichier
--save-feature=(sortie); chaîne de caractères
enregistrer les images de caractéristiques issues de l'ICA et quelques images intermédiaires
utilisé pour la segmentation RV-LV avec la base de nom de fichier donnée aux fichiers PNG.
Enregistrez également les coefficients du meilleur mélange initial et final du CI
matrice.
d’aide & Info
-V --verbose=avertissement
verbosité de la sortie, imprimer des messages de niveau donné et de priorités plus élevées.
Les priorités prises en charge à partir du niveau le plus bas sont :
info ‐ Messages de bas niveau
tracer ‐ Trace d'appel de fonction
échouer ‐ Signaler les échecs des tests
avertissement - Mises en garde
erreur - Signaler les erreurs
déboguer ‐ Sortie de débogage
message ‐ Messages normaux
fatal ‐ Ne signaler que les erreurs fatales
--droits d'auteur
imprimer les informations de copyright
-h --aide
imprimer cette aide
- ? --usage
imprimer une courte aide
--version
imprimer le numéro de version et quitter
ICA
-C --composants=0
Composantes ICA 0 = estimation automatique Composantes ICA 0 = automatique
estimation
--normaliser
circuits intégrés normalisés
--no-meantrip
ne pas enlever la moyenne des courbes de mélange
-s --segscale=1.4
segmenter et mettre à l'échelle la zone de recadrage autour du segment LV (0=pas de segmentation) et
redimensionner la zone de recadrage autour du LV (0=pas de segmentation)
-k --skip = 0
sauter les images au début de la série car elles sont d'autres
les modalités ignorent les images au début de la série car elles sont d'autres
modalités
-m --max-ica-iter=400
nombre maximum d'itérations dans ICAnombre maximum d'itérations dans ICA
-E --segmethod=caractéristiques
Méthode de segmentation
delta-pic ‐ différence des images d'amélioration de pic
Caractéristiques - des images de vedette
delta-fonctionnalité ‐ différence des images caractéristiques
En cours
--threads = -1
Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement, ce nombre doit être inférieur
ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans la machine. (-1:
estimation automatique).Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement,Ceci
doit être inférieur ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans
la machine. (-1 : estimation automatique).
EXEMPLE
Évaluez les références synthétiques de set segment.set et enregistrez-les dans refXXXX.??? par
en utilisant cinq composants indépendants et en sautant 2 images. Par défaut une boîte englobante
autour du LV sera segmenté et mis à l'échelle de 1.4 et les images recadrées seront enregistrées dans
recadrerXXXX.??? et un ensemble de segmentation cropped.set est créé. Le type de fichier image ??? est
déduit des images d'entrée dans segment.set.
mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2 -C 5
Auteurs)
Gert Wollny
DROIT D'AUTEUR
Ce logiciel est protégé par copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Allemagne et Madrid, Espagne. Ça arrive
avec ABSOLUMENT AUCUNE GARANTIE et vous pouvez le redistribuer selon les termes du GNU
LICENCE PUBLIQUE GENERALE Version 3 (ou ultérieure). Pour plus d'informations, exécutez le programme avec le
l'option '--copyright'.
Utilisez mia-2dmyocard-icaseries en ligne à l'aide des services onworks.net
