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mincdump - En ligne dans le Cloud

Exécutez mincdump dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks sur Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

Il s'agit de la commande mincdump qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS

PROGRAMME:

Nom


mincdump - Convertit les fichiers minc au format ASCII (CDL)

SYNOPSIS


mincdump [-c] [-h] [-v variable1,...] [-b long] [-F long] [-l len] [-n prénom] [-p
f_chiffres[,d_chiffres]] filet

DESCRIPTION


dépotoir est basé sur l'outil netCDF cdump, modifié pour fonctionner avec les deux MINC 1 (netCDF)
et les fichiers au format MINC 2 (HDF5). Il est principalement destiné à être utilisé avec des scripts tels que
mincdiff et tête-à-tête. Puisqu'il n'a pas été créé à l'Institut neurologique de Montréal
il ne suit pas les conventions habituelles des programmes MINC.

dépotoir génère une représentation ASCII d'un fichier minc spécifié sur la sortie standard.
La représentation ASCII est sous une forme appelée CDL (``Network Common Data form Language'')
qui peuvent être consultés, modifiés ou servir d'entrée à ngen. ngen est un programme compagnon qui
peut générer un fichier minc binaire à partir d'un fichier CDL. D'où ngen et dépotoir peut être utilisé comme
inverses pour transformer la représentation des données entre les représentations binaires et ASCII.
See ngen pour une description des représentations CDL et netCDF.

dépotoir définit un format par défaut utilisé pour chaque type de données netCDF, mais cela peut être
changé si un attribut `C_format' est défini pour une variable netCDF. Dans ce cas,
dépotoir utilisera l'attribut `C_format' pour formater chaque valeur. Par exemple, si
les données à virgule flottante pour la variable netCDF « Z » sont connues pour être précises à seulement trois
chiffres significatifs, il serait approprié d'utiliser l'attribut variable

Z:C_format = "%.3g"

dépotoir peut également être utilisé comme un simple navigateur pour les fichiers de données netCDF, pour afficher les
noms et tailles des dimensions ; noms, types et formes de variables ; noms et valeurs d'attributs ;
et éventuellement, les valeurs des données pour toutes les variables ou variables sélectionnées dans un netCDF
fichier.

dépotoir utilise `_' pour représenter les valeurs de données qui sont égales à l'attribut `_FillValue'
pour une variable, destinée à représenter des données qui n'ont pas encore été écrites. Si une variable
n'a pas d'attribut `_FillValue', la valeur de remplissage par défaut pour le type de variable est utilisée si le
la variable n'est pas de type octet.

OPTIONS


-c Afficher les valeurs de coordonner variables (variables qui sont aussi des dimensions) comme
ainsi que les déclarations de toutes les dimensions, variables et valeurs d'attribut. Données
les valeurs des variables non coordonnées ne sont pas incluses dans la sortie. C'est le
option la plus appropriée à utiliser pour un bref aperçu de la structure et du contenu d'un
fichier netCDF.

-h Afficher uniquement le entête informations dans la sortie, c'est-à-dire les déclarations de
dimensions, variables et attributs, mais aucune valeur de données pour aucune variable. Les
la sortie est identique à l'utilisation du -c option sauf que les valeurs de coordonnée
les variables ne sont pas incluses. (Au plus un des -c or -h des options peuvent être présentes.)

-v var1,...,varn
La sortie inclura des valeurs de données pour les variables spécifiées, en plus des
déclarations de toutes les dimensions, variables et attributs. Une ou plusieurs variables
doit être spécifié par son nom dans la liste délimitée par des virgules suivant cette option. Les
list doit être un seul argument de la commande, donc ne peut pas contenir d'espaces ou d'autres
caractères d'espace blanc. Les variables nommées doivent être des variables netCDF valides dans le
fichier d'entrée. La valeur par défaut, sans cette option et en l'absence du -c or -h
options, consiste à inclure des valeurs de données pour TOUTE variables dans la sortie.

-b long
Une brève annotation sous forme de commentaire CDL (texte commençant par les caractères
``//'') sera inclus dans la section de données de la sortie pour chaque `ligne' de données,
pour aider à identifier les valeurs des données pour les variables multidimensionnelles. Si long commence par
`C' ou `c', alors les conventions du langage C seront utilisées (indices de base zéro, dernier
dimension variant le plus rapidement). Si long commence par 'F' ou 'f', puis le langage Fortran
des conventions seront utilisées (indices à base unique, première dimension variant le plus rapidement). Dans
dans les deux cas, les données seront présentées dans le même ordre ; seulement les annotations
différera. Cette option est utile pour parcourir de gros volumes de
données multidimensionnelles.

-f long
Annotations complètes sous forme de commentaires CDL de fin (texte commençant par le
caractères ``//'') pour chaque valeur de données (à l'exception des caractères individuels dans le caractère
tableaux) seront inclus dans la section de données. Si long commence par « C » ou « c », puis
Les conventions du langage C seront utilisées (indices de base zéro, dernière dimension variant
le plus rapide). Si long commence par « F » ou « f », alors les conventions du langage Fortran seront
être utilisé (indices à base unique, la première dimension variant le plus rapidement). Dans les deux cas, le
les données seront présentées dans le même ordre ; seules les annotations seront différentes. Cette
L'option peut être utile pour canaliser des données dans d'autres filtres, puisque chaque valeur de données
apparaît sur une ligne distincte, entièrement identifiée.

-l len Modifie la longueur de ligne maximale par défaut (80) utilisée dans le formatage des listes de non-
valeurs de données de caractère.

-n prénom
CDL requiert un nom pour un ensemble de données netCDF, à utiliser par ngen -b en générant un
nom de fichier netCDF par défaut. Par défaut, dépotoir construit ce nom à partir du dernier
composant du chemin d'accès du fichier netCDF d'entrée en supprimant toute extension
il a. Utilisez le -n option pour spécifier un nom différent. Bien que le fichier de sortie
nom utilisé par ngen -b peut être spécifié, il peut être judicieux d'avoir dépotoir changer la
nom par défaut pour éviter d'écraser par inadvertance un fichier netCDF précieux lors de l'utilisation
dépotoir, en modifiant le fichier CDL résultant et en utilisant ngen -b générer un nouveau
netCDF à partir du fichier CDL édité.

-p float_digits[,double_digits]
Spécifie la précision par défaut (nombre de chiffres significatifs) à utiliser pour l'affichage
valeurs de données à virgule flottante ou double précision pour les attributs et les variables. Si
spécifié, cette valeur remplace la valeur de l'attribut 'C_format' pour tout
variable qui a un tel attribut. Les données à virgule flottante seront affichées avec
chiffres_flottants chiffres significatifs. Si double_chiffres est également spécifié, double-
les valeurs de précision seront affichées avec autant de chiffres significatifs. Dans le
l'absence de tout -p les spécifications, les données à virgule flottante et en double précision sont
affichés respectivement avec 7 et 15 chiffres significatifs. Les fichiers CDL peuvent être créés
plus petit si moins de précision est requise. Si à la fois virgule flottante et double pression
précisions sont spécifiées, les deux valeurs doivent apparaître séparées par une virgule (pas de
blancs) en tant qu'argument unique de la commande. Si vous voulez vraiment chaque dernier morceau de
précision du fichier netCDF représenté dans le fichier CDL pour toutes les
valeurs à virgule flottante, vous devrez le spécifier avec -p 9,17 (selon
Théorème 15 de l'article répertorié sous RÉFÉRENCES).

EXEMPLES


Regardez la structure des données dans le fichier netCDF `foo.mnc':

mincdump -c foo.mnc

Produire une version CDL annotée de la structure et des données dans le fichier netCDF `foo.mnc',
en utilisant l'indexation de style C pour les annotations :

mincdump -bc foo.mnc > foo.cdl

Données de sortie uniquement pour les variables `uwind' et `vwind' du fichier netCDF `foo.mnc', et
afficher les données à virgule flottante avec seulement trois chiffres significatifs de précision :

mincdump -v uwind,vwind -p 3 foo.mnc

Produire une liste entièrement annotée (une valeur de données par ligne) des données de la variable
« omega », en utilisant les conventions Fortran pour les indices et en modifiant le nom du jeu de données netCDF dans
le fichier CDL résultant dans `omega' :

mincdump -v omega -f fortran -n omega foo.mnc > Z.cdl

Utilisez mincdump en ligne en utilisant les services onworks.net


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