Il s'agit de la commande minctoecat qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
minctecat - convertit un fichier au format minc en un fichier au format Ecat7
SYNOPSIS
minctoecat [ ]
minctoecat [-aider]
DESCRIPTION
minctoecat convertira une image 2D, un volume 3D ou un volume dynamique 4D écrit en minc
format de fichier en un fichier 2D, 3D ou 4D Ecat7. Alors que le format Ecat7 a été conçu pour
Volume PET émis par les scanners Ecat (CTI/SIEMENS - Knoxville, TN, USA) il lit n'importe quel minc
type de volume (TEP statique, TEP dynamique, IRMa, IRMf, étiquettes) délivré nativement par tout
tomographe de la marque et la transformer en un fichier Ecat7 viable en terme de nombre de dimensions,
taille de dimension, pas de dimension, orientation, position spatiale, valeurs de voxel et voxel
unité. De plus, il fait de son mieux pour remplir les champs d'en-tête Ecat7 facultatifs à partir de
les variables et attributs minc disponibles. Par défaut, il extrait ces
informations provenant des variables minc communes, à savoir : patient_variable, study_variable,
variable_acquisition. Dans le cas de volumes livrés à l'origine par un scanner PET Ecat,
ensuite, d'autres variables sont généralement disponibles dans l'en-tête minc :
ecat_acquisition_variable, ecat_main et ecat_sub-header_variable. Là, pour un tel minc
volume, la conversion donne un volume Ecat7 presque identique au natif d'origine
volume en termes de champs d'en-tête. L'utilisateur peut modifier ce comportement en utilisant la liste des ignores
options (voir la section options).
OPTIONS
Notez que les options peuvent être spécifiées sous forme abrégée (tant qu'elles sont uniques) et
peut être donné n'importe où sur la ligne de commande.
Command groupe de neurones Options
-ignore_patient_variable : Ignorer les informations de la variable patient minc (MIpatient).
-ignore_study_variable : Ignorez les informations de la variable d'étude minc (MIstudy).
-ignore_acquisition_variable : Ignorer les informations de la variable d'acquisition minc
(MI acquisition).
-ignore_ecat_accquisition_variable : Ignorer les informations de l'acquisition minc ecat
variable (MIecat_acquisition).
-ignore_ecat_main_variable : Ignorer les informations de la variable minc ecat-mainheader
(MIecat-principal).
-ignore_ecat_subheader_variable : Ignorer les informations de la variable minc ecat-subheader
(sous-en-tête MIecat).
-no_decay_corr_fctr : ne pas régénérer les facteurs de correction de décroissance utilisés dans le cadre de
la reconstruction du volume TEP d'origine. Les facteurs de correction sont un domaine dans le
les sous-en-têtes ecat qui peuvent être utilisés par les programmes de traitement. Par défaut, si le volume est un
Volume PET, ces facteurs sont régénérés. Cette option n'a aucun intérêt en cas de non
données TEP.
-étiqueter: Traite le voxel comme des valeurs entières au lieu de valeurs à virgule flottante. Dans ce cas, le
les facteurs d'échelle et les facteurs d'étalonnage sont tous deux réglés à l'unité. Cette option est
particulièrement utile lorsque les fichiers minc d'entrée sont un volume d'étiquettes.
Général Options
-aider: Imprimer le résumé des options de ligne de commande et abandonner
-version: Imprimer la version du programme et abandonner
CONNUE BOGUES
Aucun bug répertorié pour l'instant :=)
Utilisez minctoecat en ligne en utilisant les services onworks.net
