Il s'agit de la commande newicktotxt qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
njplot - Un programme de dessin d'arbre phylogénétique pour les biologistes newicktops - dessiner phylogénétique
arbres dans un fichier PostScript
SYNOPSIS
njplot [Options] fichier_arbre
nouveaux tops [Options] fichier_arbre
nouveauwicktotxt [Options] fichier_arbre
DESCRIPTION
Cette page de manuel documente brièvement les njplot commander.
Le manuel de formation nouveaux tops La commande fait exactement la même chose mais n'a pas besoin d'affichage X11. La sortie est
rendu dans un fichier PostScript.
Le manuel de formation nouveauwicktotxt la commande fait exactement la même chose que nouveaux tops mais la sortie est rendue
dans un fichier texte.
Cette page de manuel a été réécrite pour la distribution Debian GNU/Linux car l'original
le programme n'a pas de page de manuel.
njplot est un programme de dessin d'arbre capable de dessiner n'importe quel arbre binaire ou multi-branches exprimé
dans le format d'arbre phylogénétique standard (par exemple, le format utilisé par le package PHYLIP).
NJplot est particulièrement pratique pour enraciner les arbres non racinés obtenus par parcimonie,
méthodes de construction d'arbres à distance ou à maximum de vraisemblance.
Tout enracinement de l'arbre non enraciné peut être spécifié de manière interactive à l'aide de la souris. NJplot
permet également le zoom, l'échange de branches, l'affichage des scores bootstrap et l'enregistrement dans le
Format PostScript. NJplot peut donc être utilisé comme une extension graphique de n'importe quel package
du programme phylogénétique qui utilise le format d'arbre standard pour stocker les arbres (c'est-à-dire,
avec la plupart de ces packages).
OPTIONS
Il n'y a que les options suivantes qui ne fonctionnent que dans un émulateur x-terminal, mais pas dans
mode console :
-h Imprime une brève aide.
-nous Fichier d'arborescence Postscript préparé pour le format de papier US Letter.
-psseulement
Pas d'interface fenêtre, il suffit d'écrire le fichier d'arborescence PostScript.
-Taille n
Taille de police n utilisée pour les noms de taxon.
-pc n nombre de pages pour la sortie PostScript.
-taille largeurxhauteur
taille de la page PostScript exprimée en WIDTHxHEIGHT.
-longueurs
Afficher les longueurs de branches si elles apparaissent dans le fichier arborescent.
-démarrage Afficher les valeurs d'amorçage si elles apparaissent dans le fichier d'arborescence.
-pas de titre
N'incluez pas de titre dans la sortie PostScript.
Utilisez newicktotxt en ligne à l'aide des services onworks.net
