Il s'agit de la commande obgen qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
Obgen — générer des coordonnées 3D pour une molécule
SYNOPSIS
Obgen [OPTIONS] nom de fichier
DESCRIPTION
L'outil obgen générera des coordonnées 3D pour les molécules dans un fichier (par exemple multi-molécule
fichiers SOURIRE). La structure résultante sera optimisée en utilisant le champ de force donné et
vérifié pour le conformère de plus faible énergie à l'aide d'une recherche Monte Carlo. La sortie sera envoyée à
sortie standard au format de fichier SDF.
OPTIONS
Si aucun nom de fichier n'est donné, obgen donnera toutes les options, y compris les champs de force disponibles.
-ff champ de force
Sélectionnez le champ de force
EXEMPLES
Affichez les options possibles, y compris les champs de force disponibles :
Obgen
Générez des coordonnées 3D pour la ou les molécules dans le fichier test.smi :
obgen test.smi
Générez des coordonnées 3D pour la ou les molécules dans le fichier test.smi à l'aide du champ de force UFF :
obgen -ff test UFF.smi
Utiliser obgen en ligne à l'aide des services onworks.net
