Il s'agit de la commande obspectrophore qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks à l'aide de l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
obspectrophore — Calculateur SPECTROPHORE
SYNOPSIS
obspectrophore [Options] -i fichier_entrée
obspectrophore [-u | -h]
DESCRIPTION
obspectrophore peut être utilisé pour générer des spectrophores, qui sont des descripteurs unidimensionnels
générés à partir des champs de propriétés entourant les molécules. Cette technologie permet au
description précise des molécules en termes de propriétés de surface ou de champs. Comparaison
des champs de propriétés des molécules fournit une méthode d'alignement robuste et indépendante de la structure
actifs de différentes classes chimiques. Lorsqu'il est appliqué à des molécules telles que des ligands et
médicaments, les spectrophores peuvent être utilisés comme de puissants descripteurs moléculaires dans les domaines de
chimioinformatique, criblage virtuel et modélisation QSAR.
OPTIONS
-i filet
Spécifie le fichier d'entrée moléculaire à partir duquel les spectrophores doivent être calculés. Les
le type de fichier est automatiquement détecté à partir de l'extension de fichier.
-n Plus-value
Spécifie le type de normalisation à effectuer. Les valeurs valides sont
(sans citations): Non (Par défaut), ZéroMoyenne, UnitéStd et ZéroMoyenneEtUnitStd.
-a Plus-value
Spécifie la précision requise exprimée sous forme de pas angulaire. Seuls les suivants
les valeurs discrètes sont autorisées : 1 | 2 | 5 | 10 | 15 | 20 (par défaut) | 30 | 36 | 45 | 60
-s Plus-value
Spécifie le type de cages à utiliser en termes de groupe de points sous-jacent :
P1 ou P-1. Les valeurs valides sont (sans les guillemets) : Non (Par défaut), Unique, Miroir et Tous.
-r Plus-value
Spécifie la résolution requise exprimée sous la forme d'un nombre réel positif. Le défaut
valeur est 3.0 Angström. Des valeurs négatives ou une valeur égale à 0 génèrent une erreur
par voie électronique.
-u Afficher les détails de la mise en œuvre.
-h Afficher le message d'aide.
Utiliser obspectrophore en ligne en utilisant les services onworks.net
