Il s'agit de la commande parseval qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks à l'aide de l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
parseval - analyse comparative de deux sources alternatives d'annotation
SYNOPSIS
parseval [Options] référence.gff3 prédiction.gff3
DESCRIPTION
Options de base:
-d|--déboguer :
Imprimer les messages de débogage
-h|--aide :
Imprimer le message d'aide et quitter
-l|--delta : INT
Étendre les loci de gènes de ce nombre de nucléotides ; la valeur par défaut est 0
-V|--verbeux :
Imprimer des messages d'avertissement détaillés
-v|--version :
Imprimer le numéro de version et quitter
Options de sortie :
-a|--partage de données : STRING
Emplacement à partir duquel copier les données partagées pour la sortie HTML (si `make install' n'a pas
encore été exécuté)
-f|--outformat : STRING
Indiquez le format de sortie souhaité ; options possibles : 'csv', 'text' ou 'html'
(défaut='texte'); en mode 'texte' ou 'csv', créera un seul fichier ; en 'html'
mode, va créer un répertoire
-g|--nogff3 :
Ne pas imprimer la sortie GFF3 correspondant à chaque comparaison
-o|--outfile : FILENAME
Fichier/répertoire dans lequel la sortie sera écrite ; la valeur par défaut est le terminal (STDOUT)
-p|--nopng :
En mode de sortie HTML, ignorez la génération de graphiques PNG pour chaque locus de gène
-s|--résumé :
N'imprimez que les statistiques récapitulatives, n'imprimez pas les comparaisons individuelles
-w|--écraser :
Forcer l'écrasement de tous les fichiers de sortie existants
-x|--étiquette de référence : STRING
Étiquette facultative pour les annotations de référence
-y|--predlabel : CHAÎNE
Étiquette facultative pour les annotations de prédiction
Options de filtrage :
-k|--créerfiltre
Créez un fichier de configuration par défaut pour filtrer les résultats signalés et quittez,
effectuer aucune comparaison
-r|--fichierfiltre : CHAÎNE
Utilisez le fichier de configuration indiqué pour filtrer les résultats signalés ;
-t|--maxtrans : INT
Maximum de transcriptions autorisées par locus ; utilisez 0 pour désactiver la limite ; la valeur par défaut est 32
Utiliser parseval en ligne à l'aide des services onworks.net
