Il s'agit de la commande perlprimer qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
perlprimer - spécifiez graphiquement l'amplicon des séquences d'ADN ou d'ARNm et concevez des amorces
SYNOPSIS
perlprimer
DESCRIPTION
PerlPrimer calcule la température de fusion de l'apprêt à l'aide de la méthode la plus proche de J. SantaLucia
paramètres thermodynamiques voisins. Pour ajuster les conditions de sel de la PCR,
PerlPrimer utilise la formule empirique dérivée par von Ahsen et al. (2001) et permet à la
l'utilisateur pour spécifier la concentration de Mg2+, de dNTP et d'amorces, ou utiliser la PCR standard
conditions. Le résultat est une prédiction très précise de la température de fusion de l'amorce,
donnant lieu à un rendement maximal de produit lorsqu'il est amplifié. PerlPrimer est écrit en Perl
et nécessite Perl/Tk. De plus, pour la fonctionnalité QPCR, PerlPrimer nécessite l'open-
source Spidey exécutable de NCBI. Le programme est conçu pour être multiplateforme
compatible et a été développé et testé à la fois sur Microsoft Windows et sur GNU/Linux
systèmes d'exploitation. Les utilisateurs ont également signalé le succès de l'utilisation du programme sous Mac OS X.
Utiliser perlprimer en ligne à l'aide des services onworks.net
