showtree - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

showtree - Affichez et/ou convertissez les arbres phylogénétiques dans le terminal.

SYNOPSIS

arbre d'exposition [OPTIONS] [fichier arborescent]

DESCRIPTION

Afficher et/ou convertir des arbres phylogénétiques dans le terminal.

fichier arborescent est le nom de fichier du fichier contenant les arbres au format PRIME.

OPTIONS

--Aidez-moi Afficher l'aide (ce texte).

-V, --version
Imprimer la version et quitter

-e, --show-edgetimes
Afficher les heures de pointe

-n, -show-nodetimes
Afficher les heures des nœuds

-b, --show-edgeweights
Afficher les poids des bords (c'est-à-dire les longueurs des branches)

-x, --show-tot-edgetime
Afficher le temps de contour total au lieu de l'arbre

-y, --show-tot-edgeweight
Afficher le poids total des bords au lieu de l'arbre

-c, --read-edge-fois-après-deux-points
Lire les temps de contour après les deux-points

-p, --conversion-et-arbre-de-sortie-au-format-prime
Convertir et sortir l'arborescence au format PRIME

-i, --show-id
Afficher l'ID (valable uniquement avec -p)

-S, --read-tree-from-stdin
Lire l'arborescence à partir de STDIN (non ni nécessaire)

-f, --format asciidrawing|prime|newick|simplenewick
Le format de sortie. La valeur par défaut est asciidrawing. Formats de sortie :

newick - convertir et afficher l'arborescence au format NEWICK

simplenewick - Format newick simple, aucune longueur de branche. Cela permet aussi de lire
d'arbres déséquilibrés.

premier - premier format

asciidrawing - un dessin ascii

-t, --numéro-arbre
Utilisez l'arbre avec ce numéro. Sinon, tous les arbres seront imprimés.

-t, --numéro-arbre
Utilisez l'arbre avec ce numéro. Sinon, tous les arbres seront imprimés.

EXIT STATUT

0 Exécution réussie du programme.

1 Une erreur s'est produite

URL

La page d'accueil de prime-phylo : http://prime.sbc.su.se

Utiliser showtree en ligne en utilisant les services onworks.net