Il s'agit de la commande xtractore qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
xtractore - extrait les séquences correspondant aux caractéristiques annotées de la séquence donnée
filet
SYNOPSIS
xtracteur [Options] fonctionnalités.gff3 séquences.fasta
DESCRIPTION
Options:
-d|--déboguer
imprimer la sortie de débogage
-h|--aide
imprimer ce message d'aide et quitter
-i|--idfile : FICHIER
fichier contenant une liste d'identifiants de fonctionnalités (1 par ligne sans espaces) ; s'il est fourni,
seules les fonctionnalités avec des ID dans ce fichier seront extraites
-o|--outfile : FICHIER
fichier dans lequel les séquences de sortie seront écrites ; la valeur par défaut est le terminal (stdout)
-t|--type : chaîne
type d'entité à extraire ; peut être utilisé plusieurs fois pour extraire les caractéristiques de plusieurs
types
-v|--version
imprimer le numéro de version et quitter
-V|--verbeux
imprimer des messages d'avertissement et d'erreur détaillés
-w|--largeur : INT
largeur de chaque ligne de séquence dans la sortie Fasta ; la valeur par défaut est 80 ; mis à 0 pour non
formatage
Utiliser xtractore en ligne en utilisant les services onworks.net
