Il s'agit de l'application Linux nommée ADOMA dont la dernière version peut être téléchargée sous adoma-1.0.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée ADOMA avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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ADOMA
DESCRIPTION
ADOMA signifie : Affichage alternatif de l'alignement multiple. ADOMA peut créer quatre affichages différents d'un alignement de séquences multiples : un alignement ClustalW au format HTML, un alignement ClustalW simplifié au format HTML et/ou txt et un alignement ClustalW coloré au format HTML. Pour des exemples de ces fichiers de sortie, vérifiez les captures d'écran. ADOMA utilise ClustalW pour créer l'alignement multiple à partir de séquences d'ADN ou de protéines et les affiche légèrement différemment de la sortie normale de ClustalW. ADOMA est un programme en ligne de commande qui peut facilement être utilisé dans les pipelines.
Pour plus d'informations, consultez le fichier README.md dans la section Fichiers.
Comment citer ADOMA :
Zaal, D. et Nota, B. (2016), ADOMA : un outil de ligne de commande pour modifier la sortie d'alignement multiple ClustalW. Mol. Inf., 35 : 42-44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Shell Unix, Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/adoma/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
