Il s'agit de l'application Linux nommée cupSODA à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous cupSODAv1.1.0.zip. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée cupSODA pour fonctionner gratuitement sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
cupSODA pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
cupSODA est un simulateur de systèmes biologiques qui exploite la bande passante mémoire et la capacité de calcul remarquables des GPU. cupSODA permet d'exécuter efficacement en parallèle un grand nombre de simulations, qui sont généralement nécessaires pour étudier la dynamique émergente d'un système biologique donné dans différentes conditions. cupSODA fonctionne en dérivant automatiquement le système d'équations différentielles ordinaires d'un modèle mécaniste basé sur la réaction, défini selon la cinétique d'action de masse, puis en exploitant l'algorithme d'intégration numérique, LSODAFonctionnalités:
- Conversion automatique des réactions en EDO
- Calcul automatique de la matrice Jacobienne
- Accélération GPU
- Capable de gérer des systèmes rigides et non rigides
- Évaluation de la condition physique intégrée
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/cupsoda/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
