Il s'agit de l'application Linux GAAS, utilisable en ligne sous Linux. Sa dernière version est téléchargeable sous le nom GAAS-0.17.tar.gz. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée GAAS pour l'exécuter sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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GAAS fonctionnera sous Linux en ligne
DESCRIPTION
GAAS (Genome relative Abundance and Average Size) est un outil bioinformatique permettant de calculer avec précision la composition de la communauté et la taille moyenne du génome dans les métagénomes en utilisant BLAST, l'analyse avancée des hits et la correction du biais de longueur du génome.Comment ça marche
- FASTA en entrée, graphiques en sortie
- Normalisation par longueur de génome
- Pondération des similitudes
- Intervalles de confiance statistiques
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/gaas/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
