Il s'agit de l'application Linux nommée GIIRA dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom GIIRA_01_3.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée GIIRA avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
GIRA
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DESCRIPTION
GIIRA est une méthode de prédiction de gènes qui identifie les régions codantes potentielles exclusivement sur la base de la cartographie des lectures à partir d'une expérience RNA-Seq.Il a été principalement conçu pour la prédiction de gènes procaryotes et est capable de résoudre les gènes dans la région exprimée d'un opéron. Cependant, il est également applicable aux eucaryotes et prédit les structures d'intron d'exon ainsi que d'autres isoformes.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/giira/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
