Il s'agit de l'application Linux nommée In silico fragmentation evaluation dont la dernière version peut être téléchargée sous input.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Évaluation de la fragmentation in silico avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Évaluation de la fragmentation in silico
DESCRIPTION
Nous avons comparé les performances de quatre outils de fragmentation in silico accessibles au public qui aident à l'élucidation de la structure des métabolites (MetFrag, CFM-ID, MAGMa+ et MS-FINDER).
À l'aide de la sortie de ces outils, nous avons développé un modèle de vote/consensus qui combine, réorganise et reclasse le fichier des candidats et augmente le pourcentage de réussite correct.
Nous avons utilisé 520 composés du challenge CASMI 2016 avec 312 composés pour la formation et 208 composés à des fins de validation.
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/in-silico-fragmentation/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.