Il s'agit de l'application Linux nommée INTEGRATE dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom INTEGRATE.0.2.6.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée INTEGRATE with OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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INTÉGRER
DESCRIPTION
INTÉGRER : Appeler des fusions de gènes avec des jonctions de fusion exactes et des points d'arrêt génomiques en combinant les données RNA-Seq et WGS.Pour télécharger le code source, le manuel de référence et le cas de test, veuillez vous rendre sur « Fichiers ».
Reportez-vous également à 'Wiki' pour plus de détails.
Fonctionnalités:
- Haute sensibilité et spécificité
- Jonctions de fusion exactes et points d'arrêt génomiques
- Algorithme de mappage à lecture fractionnée rapide basé sur la transformation de Burrows-Wheeler
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/integrate-fusion/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.