Il s'agit de l'application Linux nommée Kinetic Model Builder à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom KineticModelBuilder2.0-win32-2017-05-07.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Kinetic Model Builder pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Kinetic Model Builder à exécuter sous Linux en ligne
DESCRIPTION
Une interface graphique 3D pour construire, simuler et optimiser des modèles cinétiques de Markov en réponse à des stimuli dépendants du temps définis par l'utilisateur. Les modèles peuvent être représentés comme des états et des transitions de connexion ou des éléments allostériques en interaction (voir http://dx.doi.org/10.1085/jgp.201411183). Les paramètres du modèle peuvent être optimisés en adaptant les réponses du modèle aux données utilisateur. Les équations de contraintes facultatives définies par l'utilisateur pour les paramètres du modèle sont analysées avec EigenLab (https://github.com/marcel-goldschen-ohm/EigenLab). La simulation et la synthèse pratiques sur des ensembles bidimensionnels de conditions de stimulus rendent la construction de courbes stimulus-réponse incroyablement simple. Pour les canaux ioniques, cela est utile pour simuler des courbes dose-réponse ou courant-tension avec et sans stimulus secondaire (par exemple, un médicament). Une série de didacticiels vidéo sont disponibles sur https://www.youtube.com/watch?v=7I2XPkdOvCg&list=PL-J_lULjiFsCPL2pkz8_tFe_aJ4Fc8a8k&index=1.Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Qt
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/modbuilder/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.