Il s'agit de l'application Linux metaProt, utilisable en ligne sous Linux. Sa dernière version est téléchargeable sous metaprot_v0.1.tar.gz. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée metaProt pour l'exécuter sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
metaProt s'exécutera en ligne sous Linux
Ad
DESCRIPTION
metaProt est un pipeline Python pour analyser et extraire des données de séquences de protéines trouvées dans des projets métagénomiques.Il intègre plusieurs outils existants (HMMer, Pepstats, Blast...) à utiliser sur des bases de données personnalisées. Veuillez lire le fichier README.txt pour en savoir plus à ce sujet.
Comment ça marche
- Intégration des outils existants dans un pipeline unique
- Bases de données facilement personnalisables
Audience
Utilisateurs finaux avancés
Langage de programmation
Python
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/metaprot/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
