Il s'agit de l'application Linux nommée MOIRAI dont la dernière version peut être téléchargée en tant que moirai20140528.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée MOIRAI avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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Moirai
DESCRIPTION
L'analyse cap de l'expression génique (CAGE) est une technologie basée sur le séquençage pour capturer les extrémités 5' des ARN dans un échantillon biologique. Après cartographie, un pic CAGE sur le génome indique la position d'un site d'initiation transcriptionnel (TSS) actif et le nombre de lectures correspond à son niveau d'expression. CAGE est largement utilisé dans les projets FANTOM et ENCODE.
MOIRAI est un système de flux de travail compact mais flexible conçu pour effectuer les principales étapes du traitement des données et de l'analyse des données CAGE. MOIRAI dispose d'une interface graphique permettant aux chercheurs des laboratoires humides de créer, modifier et exécuter des workflows d'analyse. Des indicateurs graphiques de contrôle de la qualité sont intégrés aux flux de travail, permettant aux utilisateurs d'évaluer la qualité des données et de repérer rapidement les problèmes potentiels. Le package MOIRAI est livré avec trois flux de travail principaux permettant aux utilisateurs de cartographier, d'annoter et d'effectuer une analyse d'expression sur plusieurs échantillons.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Perl, C, PHP, Java
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/moirai/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
