Il s'agit de l'application Linux MORPHEUS pour Fidji, fonctionnant sous Linux en ligne. Sa dernière version est téléchargeable sous le nom Morpheus_.ijm. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MORPHEUS pour Fiji pour l'exécuter sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
MORPHEUS pour Fidji fonctionnera sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
MORPHEUS est un plugin Fiji/ImageJ2 pour l'évaluation automatisée de la morphométrie cellulaire à partir d'images de cultures cellulaires acquises par microscopie à fluorescence. Plus précisément, MORPHEUS travaille avec des distributions d'échantillonnage pour apprendre, de manière non supervisée et par une approche non paramétrique, à reconnaître les cellules appropriées pour une analyse ultérieure. Ensuite, l'algorithme effectue l'évaluation des descripteurs de forme de cellule les plus pertinents sur l'ensemble complet des cellules détectées. En option, l'extraction des caractéristiques du noyau et une analyse d'orientation à double échelle peuvent également être effectuées. L'ensemble de l'algorithme est mis en œuvre sous la forme d'une procédure en un clic, minimisant ainsi l'intervention de l'utilisateur et les biais et erreurs d'origine humaine qui en découlent. De cette façon, MORPHEUS se veut un outil utile pour faire face au problème de reproductibilité dans l'analyse de bio-images.Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/morpheus-for-fiji/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
