Il s'agit de l'application Linux MPICorMat, dont la dernière version est téléchargeable sous le nom MPICorMat_v3.0.tar.gz. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MPICorMat avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
MPICorMat
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DESCRIPTION
MPICorMat est un outil parallèle pour construire des matrices de similarité de corrélation dans le cadre de la procédure de génération de réseaux de co-expression de gènes. Cet outil prend en entrée une matrice avec les valeurs d'expression (une valeur flottante) pour différents gènes observés à partir de plusieurs échantillons. Il s'agit d'une parallélisation du premier module de l'outil RMTGenNet (https://github.com/spficklin/RMTGeneNet). Les utilisateurs de RMTGeneNet peuvent échanger ce module CCM par MPICorMat, bénéficier de son calcul rapide pour générer la similarité
matrice, puis utilisez la matrice de similarité comme entrée pour le deuxième module (RMM) pour
construire le réseau de co-expression génique final.
Audience
Technologie de l'information, industrie de la santé, science/recherche
Interface utilisateur
Console/Terminal, ligne de commande
Langage de programmation
C + +
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mpicormat/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
