Il s'agit de l'application Linux nommée MuffinEC dont la dernière version peut être téléchargée sous muffinec-2.0b.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez gratuitement en ligne cette application nommée MuffinEC avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
MuffinEC
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DESCRIPTION
MuffinEC est un logiciel de correction d'erreurs capable de traiter tous types d'erreurs (suppressions d'insertions, inadéquations et bases inconnues). Il prend officiellement en charge quatre technologies (Illumina, 454, ion Torrent et PacBio - expérimental) et il dispose également d'une configuration générique pour les autres (anciennes et/ou nouvelles). Il est publié sous LGPL version 3.0. MuffinEC peut utiliser des systèmes multicœurs, grâce à son implémentation OpenMP.
Nous développons la 2ème version de MuffinEC. La version bêta est déjà disponible en ligne. Les modifications sont répertoriées dans le fichier VERSION_HISTORY. Veuillez signaler tout problème que vous pourriez rencontrer à l'adresse e-mail indiquée dans le fichier README. Nous apprécions vraiment votre aide.
Fonctionnalités:
- Gère les insertions, les suppressions, les discordances, les bases inconnues
- Prend en charge Illumina, 454, Ion Torrent et PacBio (expérimental)
- Paramètre générique pour d'autres technologies
- Multithread
- Faible consommation de mémoire
Audience
Technologies de l'information, industrie de la santé, science/recherche, utilisateurs finaux avancés, développeurs, utilisateurs finaux/ordinateur de bureau
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
C + +
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/muffinec/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
