Il s'agit de l'application Linux nommée OptimizeSNP à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom Optimize1.0code.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée OptimizeSNP pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
OptimizeSNP pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Le programme applique une programmation linéaire pour minimiser le nombre de puces à ADN et d'expériences d'hybridation qui doivent être entreprises afin de couvrir la plupart des SNP exprimés prédits.Dépendances :. 1) mapl.exe doit se trouver dans le PATH système 2) CPLEX 12.2 doit être installé. cplexamp.exe doit être dans le PATH systèmemapl.exe peut être obtenu à partir de n'importe quel programme contenant AMPL. J'ai obtenu AMPL à partir de la version d'essai de MOSEK à http://www.mosek.com/. CPLEX 12.0 peut être obtenu auprès de http://www-01.ibm.com/software/integration/optimization/cplex-optimizer/. Une licence académique gratuite peut être obtenue en remplissant la demande d'initiative académique IBM.
Audience
Science / Recherche
Langage de programmation
Perl
Environnement de base de données
Fichier plat
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/optimizesnp/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
