Il s'agit de l'application Linux nommée PingPongPro à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom pingpongpro-v1.0-linux64.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée PingPongPro pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
PingPongPro pour fonctionner sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
REMARQUE IMPORTANTE : ce projet a été migré vers GitHub et n'est plus maintenu ici. Prière de se référer à:https://github.com/suhrig/pingpongpro
Les ARN interagissant avec Piwi (piARN) sont une classe de petits ARN non codants, principalement actifs dans la lignée germinale. Là, ils limitent l'effet néfaste des transposons sur le génome. Ils le font en formant un complexe avec les protéines Piwi. Le complexe se lie puis clive les molécules d'ARNm des transposons actifs. Les fragments d'ARNm résultants induisent la production de plus de piARN, renforçant ainsi la réponse anti-transposon dans une boucle d'anticipation appelée "cycle de ping-pong".
Une question clé dans la recherche sur le cycle de ping-pong est l'identification des piARN qui sont amplifiés au cours du cycle. PingPongPro est un outil en ligne de commande permettant de détecter l'activité du cycle de ping-pong dans les données piRNA-Seq.
PingPongPro a été développé à l'Institut de biologie moléculaire gGmbH à Mayence.
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
C + +
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/pingpongpro/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
